好氧反硝化菌是一类可以在有氧条件下进行反硝化活动并去除氮素的微生物，其种类包括细菌、放线菌和真菌等。自从好氧反硝化现象被发现以来，筛选并研究较多的好氧反硝化微生物主要是细菌而好氧反硝化真菌发现较少。研究中发现，真菌具有更广阔的的碳氮源使用范围和环境适应能力。基于此，本课题采用极限稀释法、BTB选择性培养基法和亚硝酸盐指示剂法相结合的方法从胶州湾河流底泥中筛选出5株具有高效好氧反硝化能力的真菌并对其进行鉴定和研究。
鉴定结果表明，这5株真菌分别属于青霉菌属、链格孢属、链格孢属、子囊菌属和镰刀菌属。在受测试的4种氮源和8种碳源中，5株真菌均能以氨氮、亚硝酸盐、硝酸盐和尿素作为氮源进行生长，均能以乙酸钠、葡萄糖、可溶性淀粉和蔗糖作为碳源进行生长，但均不能以柠檬酸钠、草酸钠和碳酸钠为碳源进行生长。青霉菌和链格孢菌不能以丁二酸钠作为碳源而子囊菌和镰刀菌则能利用丁二酸钠。5株真菌去除氨氮均采用同化利用的方式，葡萄糖、可溶性淀粉和蔗糖比乙酸钠更容易被真菌同化利用，因此在这3种碳源培养基中能够获得更高的氨氮去除率和菌干重。碳源和菌株种类共同影响培养基pH的变化，pH过高或过低是真菌去除氨氮过程中最易出现的限制性因素。
真菌对亚硝酸盐和硝酸盐的去除方式包括同化作用和反硝化作用，当碳源为葡萄糖、可溶性淀粉和蔗糖时真菌对亚硝酸盐和硝酸盐的去除率较高。在去除硝酸盐过程中，初始硝酸盐浓度过高会对菌株的生长产生抑制作用。初始硝酸盐浓度、初始pH和碳氮比对亚硝酸盐积累量影响不大，但温度和盐浓度则对部分真菌的亚硝酸盐积累量有一定的影响。5株真菌最适宜的生长温度均为30℃左右，其去除氨氮、亚硝酸盐和硝酸盐的最佳碳氮比范围分别为4~6，12~16和12~20，最适盐浓度均小于20g/L。当氨氮、亚硝酸盐和硝酸盐共存时氨氮首先被去除，其次是亚硝酸盐，硝酸盐是最不易被利用的氮源。
实验结果表明，好氧反硝化真菌在碳氮源利用范围及能力、实际环境中的生存能力和对环境条件变化的适应能力等方面均较强。真菌不仅能够去除氮化合物，而且在生长和反硝化过程中也能够去除大量的COD，青霉菌和子囊菌甚至能用于海水中的氮化合物的去除。因此，好氧反硝化真菌在富含有机物的实际水环境除氮中具有巨大的潜力。